科学研究
刘阳, 希尼尼根, 于景丽, 白雪梅, 张琛佳, 何宁儿, 于斯琴, 其格勒, 冯新慧, 苏布登格日勒, 娜仁花, 刘玉兰
选择哺乳期健康的8对西门塔尔母子牛,通过细菌群落16S rRNA基因高通量测序分析、PICRUSt2功能预测、文献计量学等方法研究肠道菌群结构功能组成,旨在探明8对母子牛肠道微生物的关联性。结果表明,厚壁菌门的梭菌属和葡萄球菌属等、螺旋体门的密螺旋体属、软壁菌门的支原体属、变形菌门的立克次氏体属和螺杆菌属等共20个优势潜在病原菌属的相对丰度分布存在个体差异。母代成牛Ch1-2、Ch7-8对应的子代犊牛Du1-2、Du7-8菌群组成聚为母子簇;Ch3-6和Du3-6分别聚为母代成牛簇和子代犊牛簇。金黄色葡萄球菌及幽门螺杆菌等4条病原菌感染通路聚类分析显示,Ch1-4与Du1-4母子对为低风险感染组;Ch5-8与Du5-8母子对为高风险感染组。金黄色葡萄球菌感染通路对葡萄球菌属丰度分布变异的总解释度为12.98%,两者间存在极显著(P<0.01)正相关关系,相关性系数r=0.881。母子对潜在病原菌属和感染通路丰度均存在极显著(P<0.01)正相关关系,相关性系数r=0.746-0.927和r=1.000-1.000,说明母子对肠道潜在优势病原菌结构及功能组成密切相关。综上,8对健康母子牛肠道中均存在潜在病原菌,其菌群结构与感染通路相对丰度的分布存在个体差异但两者密切相关,可划分为高风险和低风险感染母子组。